ＪＣ総研は、両研究所の経営資源を統合することで、研究活動の強化とＪＡをはじめとする協同組合組織の発展をめざす。
　会長にはＪＡ全中の茂木守会長、理事長には薄井寛氏、研究所長には今村奈良臣東大名誉教授がそれぞれ引き続いて就任した。役員には新たに漁協、森組、生協から理事２人、監事１人が就任した。
　組織体制は、食料・農業やＪＡなどの研究と『総研レポート』『叢書』を発行する基礎研究部、協同組合運動の教育支援や『にじ』を発行する協同組合研究部、人事労務研究やファーマーズマーケットなどをコンサルタントする経営相談部、企画総務部の４部。

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　役員体制は次の通り（敬称略）。
【会長】
茂木守（ＪＡ全中会長、非常勤）
【理事長】
薄井寛
【専務理事】
吉田正己（ＪＡ共済連出向）
【常務理事】　（３人）
▽黒滝達男（農林中金出向）
▽稲垣伸司（ＪＡ全農出向）
▽松岡公明（ＪＡ全中出向）
【理事】　（11人）
▽土屋博（ＪＡ全中常務理事）
▽加藤一郎（ＪＡ全農専務理事）
▽勝瑞保（ＪＡ共済連常務理事）
▽鳥井一美（農林中金専務理事）
▽松原博（日本農業新聞代表取締役社長）
▽柳楽節雄（家の光協会専務理事）
▽森澤重雄（ＪＡ全国共済会専務理事）
▽長島俊一（ＪＡ福島中央会常務理事）
▽三木久和（ＪＡ兵庫中央会専務理事）
▽芳賀唯史（日本生活協同組合連合会専務理事）
▽山本忠夫（全国漁業協同組合連合会専務理事）
【監事】　（３人）
▽榎本進（ＪＡ全厚連代表理事理事長）
▽藤本隆明（農協観光常務取締役）
▽岩川尚美（全国森林組合連合会相談役）