ゲノム情報データを素早く検索 AgrIDを公開2014年5月22日
農業生物資源研究所がデータベース開発
農業生物資源研究所(生物研)は、農畜産物の大量のゲノム情報を1カ所で解析可能なデータベース「農畜産物ゲノム情報データベース(AgrID、アグリッド)」を開発した。データベースはインターネット上で公開されている。
近年、遺伝子研究が急速に進み、超高速のゲノム解読機械なども開発されている。しかし、そのデータは個々の研究者が個別に作成し、系統立てて整理されていないため、解読はできてもその先の研究が滞るなどの問題があった。
AgrIDは、こうした課題を解決しようと、文科省、厚労省、農水省、経産省と連携して開発したもの。米国ペンシルベニア州立大が開発したシステムGalaxyを利用し、日本用に改良した。
農畜産物にかかわる大量の既存データを簡単に検索し、利用することができる。これにより、従来、ゲノムの解析・管理に必要だった大型コンピューターがなくても研究がすすめられるため、「育種の加速が期待できる」(生物研)。
生物研では今後、このデータベースの「見つける」「使う」機能をさらに発展させ、ゲノム研究の基盤として運用していきたいとしている。
AgrIDのURLは、
http://agrid.dna.affrc.go.jp/
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