栽培ギク品種育成で活用 キク属モデル系統の高精度全ゲノム塩基配列を決定2021年10月28日
広島大学大学院統合生命科学研究科の草場信教授と東京大学大学院、かずさDNA研究所、農研機構などの共同研究チームは、栽培ギク（六倍体）によく似た性質を持つ日本原産の二倍体種・キクタニギクの純系化系統（Gojo‐0）の高精度全ゲノム塩基配列を取得し、高精度・染色体レベルで決定することに成功した。
様々な花の形態・花色を持つ栽培ギク
栽培ギクは世界三大花きにも数えられる、日本の切り花生産の3分の1を占める重要な花き品目。栽培ギクの花は江戸時代以前からの長い間の品種改良の結果、多様な形と色があり、その品種分化の解明には興味深いものがある。
いわゆる「菊」は、ゲノムを6セットもつ六倍体であるうえ、自家不和合性であるためヘテロ性が高い。そのゲノム構造は非常に複雑で、栽培ギクで遺伝学的研究を行うのは難しい。この問題を克服するため、栽培ギクに良く似た性質を持つ二倍体種キクタニギクの純系化系統Gojo‐0がモデル系統として開発されている。
全ゲノム塩基配列を用いて作成された分子系統樹
同研究では、栽培ギク（六倍体）によく似た性質を持つ日本原産の二倍体種・キクタニギクの純系化系統Gojo0の高精度全ゲノム塩基配列を取得。キクタニギクの全ゲノムは3.15Gbと比較的大きいが、染色体に対応した9つの連続した配列でその95％をカバーすることができた。キク連の植物において染色体レベルの全ゲノム塩基配列が報告されたのは世界で初めて。キクタニギクのゲノムは栽培ギクのゲノムとよく似ていることが分かり、得られたゲノム情報は栽培ギク品種改良に非常に有用であると考えられる。
キクタニギクゲノムにはレトロトランスポゾンをはじめ、多くの反復配列が含まれていることが分かった。また、今回新たに発見されたレトロトランスポゾンSbdRTは、遺伝子領域周辺に転移しやすいことが明らかになった。
同研究成果は10月7日、科学誌「CommunicationsBiology」にオンラインで掲載された。
重要な記事
最新の記事
-
シンとんぼ（150）－改正食料・農業・農村基本法（36）－2025年7月12日 -
みどり戦略対策に向けたＩＰＭ防除の実践（67）【防除学習帖】第306回2025年7月12日 -
農薬の正しい使い方（40）【今さら聞けない営農情報】第306回2025年7月12日 -
【注意報】水稲に斑点米カメムシ類 県下全域で多発のおそれ 茨城県2025年7月11日 -
【注意報】斑点米カメムシ類 県内全域で多発のおそれ 新潟県2025年7月11日 -
【注意報】果樹に大型カメムシ類 果実被害多発のおそれ 北海道2025年7月11日 -
【注意報】果樹カメムシ類 県内全域で多発のおそれ 福島県2025年7月11日 -
【注意報】おうとう褐色せん孔病 県下全域で多発のおそれ 山形県2025年7月11日 -
【第46回農協人文化賞】出会いの大切さ確信 共済事業部門・全国共済農協連静岡県本部会長 鈴木政成氏2025年7月11日 -
【第46回農協人文化賞】農協運動 ＬＡが原点 共済事業部門・千葉県・山武郡市農協常務 鈴木憲氏2025年7月11日 -
政府備蓄米 全農の出荷済数量 80％2025年7月11日 -
【'25新組合長に聞く】ＪＡ加賀（石川） 道田肇氏（6/21就任） ふるさとの食と農を守る2025年7月11日 -
【'25新組合長に聞く】ＪＡ新みやぎ（宮城） 小野寺克己氏（6/27就任） 米価急落防ぐのは国の責任2025年7月11日 -
（443）矛盾撞着：ローカル食材のグローバル・ブランディング【三石誠司・グローバルとローカル：世界は今】2025年7月11日 -
【2025国際協同組合年】協同組合の父 賀川豊彦とＳＤＧｓ 連続シンポ第4回第二部2025年7月11日 -
米で5年間の事前契約を導入したＪＡ常総ひかり 令和7年産米の10％強、集荷も前年比10％増に ＪＡ全農が視察会2025年7月11日 -
旬の味求め メロン直売所大盛況 ＪＡ鶴岡2025年7月11日 -
腐植酸苦土肥料「アヅミン」、JAタウンで家庭菜園向け小袋サイズを販売開始 デンカ2025年7月11日 -
農業・漁業の人手不足解消へ 夏休み「一次産業 おてつたび特集」開始2025年7月11日 -
政府備蓄米 全国のホームセンター「ムサシ」「ビバホーム」で12日から販売開始2025年7月11日
みどり戦略
注目のテーマ
注目のテーマ
ＪＡ人事
