小さなトマト「マイクロトム」遺伝子型の比較と高精度全ゲノム解読から品種改良へ2024年7月23日
かずさDNA研究所、筑波大学、大阪公立大学、国際農林水産業研究センターは共同で、小さなトマト「マイクロトム」の全ゲノムを高精度に解読した。
6系統のマイクロトム
マイクロトムは、アメリカで観賞用として開発されたトマトで、非常に小さく、種を播いてから3～4か月で次の世代の種子を取れることから、研究用のモデル品種として使われている。
これまでの研究から、マイクロトムには遺伝的に異なるいくつかの系統があることが分かっていたが、世界に広がった経路や、表現型や遺伝子型の違いについての研究報告はなかったことから、アメリカ、フランス、ブラジルと日本の3つの研究機関から6系統のマイクロトム（写真）を集めて、かずさDNA研究所が維持してきたマイクロトムの全ゲノムを解読。また、6系統の遺伝的な違いや、植物体の形や果実の大きさなどの違いを明らかにした。
さらに、筑波大学が維持してきたマイクロトムの全ゲノムを新たに解読。特に、このゲノム解析には、最新のDNA分析技術を利用したため、従来の技術では読み取ることが難しかったゲノム領域の塩基配列を、ほぼ完全に読み取ることができた。
今回明らかになった高精度なゲノム情報を利用することで、トマトをはじめとする野菜類の新たな品種の育成や遺伝学の研究がより速く進むことが期待される。筑波大学などが開発し、世界初のゲノム編集食品として販売されている高GABA含有トマト「シシリアンルージュ・ハイギャバ」も、マイクロトムの研究成果から生み出されたトマト。
研究成果は6月4日、国際学術雑誌『DNA ResearchとPlant Biotechnology』に掲載。また、7月19日にオンライン公開された。
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