重要植物病原体ウイロイドの病原性を予測 アルゴリズムを開発 農研機構2024年11月7日
農研機構は、植物の重要病原体であるウイロイドの病原性を予測するアルゴリズムを開発した。このアルゴリズムは、今回対象とした「ジャガイモやせいもウイロイド」だけでなく、他のウイロイドにも応用が可能なことから、野菜・果樹・花き類のウイロイド被害の低減につながると期待される。
PSTVdに感染したジャガイモの塊茎と健全なジャガイモの塊茎(左)と
強毒性から弱毒性まで示す各PSTVd変異体に感染したトマトと健全なトマト(右)
近年、野菜や果樹、花き類に病害を引き起こすウイロイド病害が、感染種子等の国際的な移動によって世界各地で発生している。これらのウイロイドに感染した植物に対し有効な薬剤はなく、一度感染すると、感染植物を全て廃棄処分しなければならない。また、1つのウイロイド種の中には多数の変異体が存在しており、それぞれ異なる病原性を示す。
こうしたウイロイドの病原性を評価するには、周辺ほ場への拡散を防ぐ隔離施設で、評価対象の植物にウイロイドを接種し、数か月間の栽培試験を経て発病の有無などの植物の反応を観察する必要がある。また、接種するウイロイドや植物の種類が増えると、それらの組み合わせが増加し、病徴の強度の判定に必要なコストも膨大になる。
そこで農研機構は、トマトやジャガイモにおける重要病原体である"ジャガイモやせいもウイロイド(PSTVd)"の各変異体の病原性を予測するアルゴリズムを開発した。このアルゴリズムでは、それぞれの変異体がトマトにもたらす病徴の強度をコンピュータ上で予測。同アルゴリズムを用いると、栽培試験無しで多くのPSTVd変異体の病徴を一度に予測できるようになり、重大な被害を与える変異体を短期間で判定することが可能となる。
また、気づかないうちにウイロイドに無症状感染したトマトを栽培し蔓延してしまうリスクのあるPSTVd変異体の予測も可能。仮に、PSTVdがトマトにおいて無症状感染であっても、他の植物種に感染すると発病するリスクがあることから、無症状感染によって潜伏したウイロイドが汚染源となることを未然に防止することで、ウイロイドの感染による被害の低減に役立つことが期待される。
同研究で開発したアルゴリズムは、データベースで公開されているウイロイドのゲノム情報と宿主植物であるトマトのゲノム情報を利用してウイロイドによる病徴の強度を予測している。野菜や果樹、花きに感染するウイロイドは多数存在し、PSTVdと同様に、多数の変異体が報告されており、病原性も様々。将来的には、ウイロイド研究者や植物防疫に関係する専門家がこのアルゴリズムを利用して、トマト以外の様々な重要作物とウイロイドの組み合わせに対し、ウイロイドに感染した時の病徴の強度を予測することも可能になる。
これにより、接種試験のための栽培管理に要する労力や時間・場所が大幅に削減され、より効率的にウイロイドに感染した際のリスク評価やその評価を基にしたウイロイドの侵入や潜伏リスクの評価などが可能となる。
重要な記事
最新の記事
-
シンとんぼ(139)-改正食料・農業・農村基本法(25)-2025年4月26日
-
みどり戦略対策に向けたIPM防除の実践(56)【防除学習帖】第295回2025年4月26日
-
農薬の正しい使い方(29)【今さら聞けない営農情報】第295回2025年4月26日
-
1人当たり精米消費、3月は微減 家庭内消費堅調も「中食」減少 米穀機構2025年4月25日
-
【JA人事】JAサロマ(北海道)櫛部文治組合長を再任(4月18日)2025年4月25日
-
静岡県菊川市でビオトープ「クミカ レフュジア菊川」の落成式開く 里山再生で希少動植物の"待避地"へ クミアイ化学工業2025年4月25日
-
25年産コシヒカリ 概算金で最低保証「2.2万円」 JA福井県2025年4月25日
-
(432)認証制度のとらえ方【三石誠司・グローバルとローカル:世界は今】2025年4月25日
-
【'25新組合長に聞く】JA新ひたち野(茨城) 矢口博之氏(4/19就任) 「小美玉の恵み」ブランドに2025年4月25日
-
水稲栽培で鶏ふん堆肥を有効活用 4年前を迎えた広島大学との共同研究 JA全農ひろしま2025年4月25日
-
長野県産食材にこだわった焼肉店「和牛焼肉信州そだち」新規オープン JA全農2025年4月25日
-
【JA人事】JA中札内村(北海道)島次良己組合長を再任(4月10日)2025年4月25日
-
【JA人事】JA摩周湖(北海道)川口覚組合長を再任(4月24日)2025年4月25日
-
第41回「JA共済マルシェ」を開催 全国各地の旬の農産物・加工品が大集合、「農福連携」応援も JA共済連2025年4月25日
-
【JA人事】JAようてい(北海道)金子辰四郎組合長を新任(4月11日)2025年4月25日
-
宇城市の子どもたちへ地元農産物を贈呈 JA熊本うき園芸部会が学校給食に提供2025年4月25日
-
静岡の茶産業拡大へ 抹茶栽培農地における営農型太陽光発電所を共同開発 JA三井リース2025年4月25日
-
静岡・三島で町ぐるみの「きのこマルシェ」長谷川きのこ園で開催 JAふじ伊豆2025年4月25日
-
システム障害が暫定復旧 農林中金2025年4月25日
-
神奈川県のスタートアップAgnaviへ出資 AgVenture Lab2025年4月25日